Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
KLHL4Q9C0H6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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