Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms