Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms