Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSPG4P5Q96PW8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms