Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms