Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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