Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VITQ6UXI7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VITQ6UXI7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms