Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms