Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms