Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SP6Q3SY56 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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