Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GEN1Q17RS7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GEN1Q17RS7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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