Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms