Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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