Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFTN1Q14699 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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