Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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HTR4Q13639 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HTR4Q13639 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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