Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms