Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCNT1Q02742 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms