Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MDM2Q00987 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDM2Q00987 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms