Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms