Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P62684 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms