Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP46P62068 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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