Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms