Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ERVS71-1P61550 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms