Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2FP61218 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms