Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCCD1P59942 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms