Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIP1P50238 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms