Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGAEP38570 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms