Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms