Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms