Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT4P19013 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT4P19013 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT4P19013 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT4P19013 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms