Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms