Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RGPD2P0DJD1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RGPD2P0DJD1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms