Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCNDBP1O95273 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCNDBP1O95273 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCNDBP1O95273 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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