Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms