Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B4DLN1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DLN1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DLN1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DLN1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DLN1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
B4DLN1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B4DLN1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B4DLN1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms