Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOBPA7XYQ1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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