Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C4orf47A7E2U8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C4orf47A7E2U8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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