Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTF2Q9UNY4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms