Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH7Q9ULB5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms