Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COMMD8Q9NX08 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COMMD8Q9NX08 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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