Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN6Q9NWW5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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