Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL11Q9NVR0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL11Q9NVR0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms