Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCND1Q9NSA2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCND1Q9NSA2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms