Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRAMD1AQ96CP6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms