Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ABLIM1-204ENST00000369256 3203 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 CSF2RA-202ENST00000355805 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TNIP3-203ENST00000507879 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 LAMB4-203ENST00000418464 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AC005261.1-201ENST00000601567 712 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AL035681.1-201ENST00000441316 2500 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 CAVIN2-201ENST00000304141 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PFKM-225ENST00000551804 2797 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AC015883.1-201ENST00000623054 2074 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 KNG1-202ENST00000287611 1720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 FO393415.1-201ENST00000314481 2255 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 RNF185-201ENST00000266252 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AL389885.1-201ENST00000447227 384 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ST7-AS1_2.1-201ENST00000615247 111 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 NT5C1B-201ENST00000304081 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 CLDN2-202ENST00000540876 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 CTCFL-221ENST00000608903 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TAF6-213ENST00000472509 2551 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 VRTN-201ENST00000256362 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SVIPQ8NHG7 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms