Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms