Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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