Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms