Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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