Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PHYHD1Q5SRE7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms